Biological data processor, biological data measuring method, program and recording medium

生体情報処理装置および方法、プログラム並びに記録媒体

Abstract

【課題】DNAチップのハイブリダイゼーションを、構成を複雑にすることなく、低コストで正確に測定することができるようにする。 【解決手段】 スポット境界461の内部の面積を有するデブリ463をスポット内領域522とし、デブリ463を除くスポット境界461の内部の領域をスポット内領域521とする。各スポット内領域521,522に対して、その信頼度に基づいてフラグfを設定する。信頼度の低いスポット内領域のデータは利用しないようにする。本発明は、DNAチップの蛍光強度を測定する装置に適用することができる。 【選択図】図30
<P>PROBLEM TO BE SOLVED: To accurately measure the hybridization of a DNA chip at a low cost without complicating a constitution. <P>SOLUTION: A debris 463 having the area in a spot boundary 461 is set to a spot inner region 522 and the region in the spot boundary 461 excepting the debris 463 is set to a spot inner region 521. A flag (f) is set to the respective spot inner regions 521 and 522 on the basis of its reliability. The data in the spot inner region low in reliability is not utilized. This biological data processor can be adapted to an apparatus for measuring the fluorescence intensity of the DNA chip. <P>COPYRIGHT: (C)2007,JPO&amp;INPIT

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Patent Citations (11)

    Publication numberPublication dateAssigneeTitle
    JP-2002350350-ADecember 04, 2002Olympus Optical Co Ltd, オリンパス光学工業株式会社Biochemical inspection method
    JP-2003121441-AApril 23, 2003Hitachi Software Eng Co Ltd, 日立ソフトウエアエンジニアリング株式会社バイオチップ、蛍光シグナル処理方法及びハイブリダイゼーション反応結果表示方法
    JP-2004340574-ADecember 02, 2004Toagosei Co Ltd, 東亞合成株式会社アレイにおけるスポットの均一性評価方法
    JP-2004340738-ADecember 02, 2004Sysmex Corp, シスメックス株式会社細胞分類装置とシステム及び細胞分類方法
    JP-2006170670-AJune 29, 2006Sony Corp, ソニー株式会社遺伝子発現量規格化方法、プログラム、並びにシステム
    JP-2006300795-ANovember 02, 2006Sony Corp, ソニー株式会社生体情報測定装置および方法、プログラム並びに記録媒体
    JP-2006300796-ANovember 02, 2006Sony Corp, ソニー株式会社Biological data processor, biological data measuring method, program and recording medium
    JP-2006300797-ANovember 02, 2006Sony Corp, ソニー株式会社生体情報処理装置および方法、プログラム、記録媒体、並びに基板
    JP-2006300798-ANovember 02, 2006Sony Corp, ソニー株式会社Biological data processor, biological data measuring method, program and recording medium
    WO-03070938-A1August 28, 2003Ajinomoto Co., Inc.Analyseur de donnees d'expression genique et procede, programme et support d'enregistrement pour l'analyse des donnees d'expression genique
    WO-2004015418-A1February 19, 2004Smartbead Technologies LimitedSysteme d'analyse

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    Title

Cited By (6)

    Publication numberPublication dateAssigneeTitle
    JP-2007278985-AOctober 25, 2007Hamamatsu Photonics Kk, 浜松ホトニクス株式会社光測定装置、光測定方法、及び光測定プログラム
    JP-2009068996-AApril 02, 2009Panasonic Corp, パナソニック株式会社Microarray device and microarray analysis method
    JP-2014512546-AMay 22, 2014コーニンクレッカ フィリップス エヌ ヴェ光学的不均一性による分析評価
    JP-4894860-B2March 14, 2012株式会社島津製作所核酸塩基配列信頼度の算定方法
    US-8155889-B2April 10, 2012Shimadzu CorporationMethod for assessing degree of reliability of nucleic acid base sequence
    WO-2008068831-A1June 12, 2008Shimadzu CorporationMethod of assessing degree of reliability for nucleic acid base sequence